Viktiga transkriptionsfaktor- "switchar" i neuroblastom identifierade
I en nyligen publicerad studie i Developmental Cell har forskare vid Karolinska Institutet skapat en omfattande karta över neuroblastom på cellulär nivå genom att integrera enkelcells-transkriptomik, enkelcells-multiomik och spatial transkriptomik.
Högrisk-neuroblastom dödar ungefär hälften av de barn som drabbas eftersom tumören kan byta cellidentitet och därmed undgår behandling. Genom att kombinera enkelcells-multiomik med spatial transkriptomik har forskarna vid Karolinska Institutet konstruerat en cell-för-cell-karta över dessa tillståndsövergångar.
Genom att försöka förstå vad som driver dessa skiften, identifierade forskarna i studien viktiga transkriptionsfaktor- "switchar" vars blockering låser cancern i ett mindre aggressivt tillstånd.
Kan påverka effektiviteten av befintliga behandlingar
−Högrisk-neuroblastom förblir dödlig eftersom dess tumörceller kan ändra sin transkriptomiska identitet och därmed undvika behandling. Vår studie pekar ut det intermediära 'bro'-celltillståndet som möjliggör denna plasticitet och kartlägger de genreglerande nätverken som styr det, vilket ger forskare tydliga molekylära mål för nya läkemedel- och kombinationsbehandlingar, förklarar Yizhou Hu, medförfattare och forskare vid institutionen för laboratoriemedicin vid Karolinska Institutet.
Fynden belyser också tumörmikromiljöns roll i att upprätthålla aggressiva celltillstånd. Tumörassocierade makrofager och cancerassocierade fibroblaster visade sig samlas runt bro- och neural crest-liknande tumörceller, vilket stödjer deras beteende.
−Genom att rikta in sig på de nyligen identifierade transkriptionsfaktor-switcharna, eller den stödjande mikromiljön, kan vi låsa tumören i ett mindre farligt tillstånd och förbättra effektiviteten av befintliga behandlingar. Ett diagnostiskt test som mäter andelen bro/neural crest-tillståndsceller kan hjälpa kliniker att bestämma lämplig behandlingsnivå för varje patient", säger Patrik Ernfors, medförfattare och professor vid institutionen för medicinsk biokemi och biofysik vid Karolinska Institutet.
Forskarna planerar nu att studera sätt att störa den mikromiljö-nisch som upprätthåller högrisk-celltillstånd i neuroblastom. De vill även utveckla en praktisk diagnostisk metod baserad på deras enkelcells-signaturer och testa nya terapeutiska metoder som riktar sig mot transkriptionsfaktorkretsarna som driver förändringar i tumörcellerna.
Samarbete och finansiering
Studien genomfördes tillsammans med professor Jian Wang (Children’s Hospital of Soochow University, Kina), och i nära samarbete med universitetslektor Susanne Schlisio (Karolinska Institutet, Sverige), professor Arthur Tischler (Tufts Medical Center, USA), och professor Ronald R. de Krijger (Princess Máxima Center for Pediatric Oncology, Nederländerna).
Finansiärer: Svenska Medicinska Forskningsrådet, Cancerfonden, Knut och Alice Wallenbergs Stiftelse, SSMF, Åke Wiberg Forskningsstipendium, Karolinska Institutets Forskningsstipendium.
Publikation
Single-cell MultiOmics and spatial transcriptomics demonstrate neuroblastoma developmental plasticity.
Xu Y, Lou D, Chen P, Li G, Usoskin D, Pan J, Li F, Huang S, Hess C, Tang R, Hu X, Yu J, Arceo M, de Krijger RR, Tischler AS, Schlisio S, Ernfors P, Hu Y, Wang J
Dev Cell 2025 May;():