Ökad kunskap om cancerläkemedel kan förbättra behandlingar

– I denna studie har vi vidareutvecklat vår tidigare metodik för att bättre förstå måltavlorna för ibrutinib, ett allmänt använt läkemedel vid behandling av vissa leukemiformer. Förutom att identifiera nya måltavlor för ibrutinib kunde vi för första gången tydligt visa att ibrutinib interagerar på olika sätt med olika varianter av samma protein, säger Rozbeh Jafari, docent vid institutionen för onkologi-patologi, Karolinska Institutet och studiens sisteförfattare.

Den nya metoden baseras på termisk proteomik, där forskarna mäter specifika fysikaliska skillnader mellan proteinformerna, deras så kallade termostabilitet. Genom att mäta termostabiliteten av enskilda proteinfragment, så kallade peptider, har forskarna i tidigare studier kunnat särskilja peptider med liknande mönster. Detta gör det möjligt att upptäckta funktionella proteinformer.

I en vidareutveckling av teknologin har man studerat hur läkemedel påverkar proteinformerna och deras termostabilitet. I studier av ibrutinib observerade forskarna att läkemedlet påverkade termostabiliteten hos specifika funktionella proteinformer. Genom att studera hur läkemedel påverkar proteinernas termostabilitet har forskarna kunnat identifiera specifika funktionella proteinformer och deras interaktioner med läkemedel. 

Betydelse för läkemedelsutveckling