Ny metod för djupgående plasma-proteomprofilering

Metoden utnyttjar en naturlig liten molekyl, fosfatidylkolin, för att avlägsna högförekomstproteiner som albumin, serotransferrin och haptoglobin från plasmaprover. Genom att kombinera fosfatidylkolin med en enda nanopartikel kunde forskarna kvantifiera cirka 1 450 proteiner i ett enda plasmaprov.

−Vår patenterade teknik som kombinerar fosfatidylkolin med en enda nanopartikel ökar avsevärt djupet av plasma-proteomprofilering. Det gör det möjligt för oss att studera proteiner med lägre förekomst, vilket banar väg för upptäckten av nya biomarkörer, säger Amir Ata Saei, en av huvudförfattarna och biträdande professor vid institutionen för mikrobiologi, tumör- och cellbiologi vid Karolinska Institutet.

Tidigare upptäckt av sjukdomar som cancer och neurodegenerativa störningar är avgörande för effektiv förebyggande och behandling. Den nya metoden som utvecklats av forskarna kan leda till betydande framsteg i identifieringen av biomarkörer för dessa tillstånd.

−Funktion kommer att göra det möjligt för oss att studera proteiner med lägre förekomst för upptäckten av nya biomarkörer mot en rad sjukdomar, särskilt olika typer av cancer och neurodegenerativa sjukdomar, säger Amir Ata Saei.

Samarbete

Studien var ett samarbete mellan Amir Ata Saei vid institutionen för mikrobiologi, tumör- och cellbiologi vid Karolinska Institutet och Dr. Morteza Mahmoudis grupp vid Michigan State University.

Publikation

Small molecule modulation of protein corona for deep plasma proteome profiling, Ali Akbar Ashkarran , Hassan Gharibi , Seyed Amirhossein Sadeghi , Seyed Majed Modaresi , Qianyi Wang , Teng-Jui Lin , Ghafar Yerima , Ali Tamadon , Maryam Sayadi , Maryam Jafari , Zijin Lin , Danilo Ritz , David Kakhniashvili , Avirup Guha , Mohammad R K Mofrad , Liangliang Sun , Markita P Landry , Amir Ata Saei , Morteza Mahmoudi, Nature Communications, online 
7 november 2024, doi; 10.1038/s41467-024-53966-z