AI visar hur läkemedel påverkar cancerceller från äggstockar
I en studie på cancerceller från äggstockar visar forskare från Karolinska Institutet med hjälp av AI hur omgivningen runt tumören påverkar hur cancercellerna reagerar på läkemedel. Studien har publicerats i tidskriften Communications Biology.
Cancercellerna odlades tillsammans med fibroblaster, en typ av stödjeceller, och behandlades med olika läkemedel. Avancerade datorprogram användes för att analysera bilder av cancercellerna för att se hur de förändrades. Fibroblaster spelar en viktig roll i tumörens mikromiljö. De kan främja tumörens tillväxt, spridning och läkemedelsresistens samt även påverka immunsystemet.
- Vår studie visar att äggstockscancerceller odlade tillsammans med fibroblaster ändrar sitt utseende när de behandlas med läkemedel. Detta visar hur omgivningen runt tumören påverkar hur cancercellerna reagerar på läkemedel, säger Osheen Sharma, doktorand vid institutionen för onkologi-patologi, Karolinska Institutet, och studiens försteförfattare.
Genom att studera hur cancerceller ser ut när de odlas med fibroblaster, får vi bättre förståelse för hur dessa stödjeceller påverkar cancerns utveckling och hur läkemedel fungerar. Detta kan hjälpa oss att utveckla bättre behandlingar för cancer.
AI-analys av cancerceller
- Vi tog över 61 000 bilder av cancerceller och fibroblaster som behandlades med 528 olika läkemedel. Sedan använde vi avancerade datorprogram för att analysera bilderna och se hur cancercellerna förändrades. Vi kontrollerade också att vårt datorprogram kunde känna igen liknande förändringar från läkemedel med samma verkningsmekanism, berättar Brinton Seashore-Ludlow, docent vid samma institution och studiens sistaförfattare.
Forskarna kommer nu att undersöka hur cancerceller och fibroblaster direkt påverkar varandra för att förstå hur cellerna kommunicerar inom tumören. De delar också sitt bildmaterial så att andra kan använda det i sin forskning om cancer och läkemedel.
Denna forskning belyser hur olika läkemedel påverkar cancerceller på olika sätt och understryker den stora variationen i cancercellers utseende och deras reaktioner på behandlingar.
Forskningen finansierades bland annat av Vetenskapsrådet, Karolinska Institutet, Sagens stiftelse, Knut och Alice Wallenbergs stiftelse och Finlands Akademi.
Publikation
Evaluating feature extraction in ovarian cancer cell line co-cultures using deep neural networks.
Sharma O, Gudoityte G, Minozada R, Kallioniemi OP, Turkki R, Paavolainen L, Seashore-Ludlow B
Commun Biol 2025 Feb;8(1):303"