Wheelock Lab utökar kapaciteten för masspektrometri
Forskargruppen ledd av Craig Wheelock vid Institutet för miljömedicin (IMM) har nyligen stärkt sina analytiska resurser genom att införskaffa två nya masspektrometrar. Med totalt sex instrument i drift är Wheelock-labbet nu en av de mest välutrustade masspektrometrifaciliteterna inom sitt område.
En av de nyinköpta plattformarna introducerar avancerad masspektrometriavbildning (MSI), vilket kraftigt utökar laboratoriets kapacitet inom det snabbt växande området spatial biologi. Denna banbrytande teknik gör det möjligt för forskare att kartlägga molekylers rumsliga organisation och interaktioner i sina naturliga biologiska miljöer. Genom att direkt avbilda metaboliter i vävnadsprover ger plattformen kraftfulla kemiska insikter som gör det möjligt att visualisera små molekylers fördelning och förstå deras roller i komplexa biologiska processer.
Postdoktorn Matt Smith leder utvecklingen av innovativa arbetsflöden för masspektrometriavbildning (MSI) i samarbete med Waters Corporation på Solna Campus, med stöd från National Bioinformatics Infrastructure Sweden (NBIS). Dessa avancerade metoder gör det möjligt att direkt avbilda metaboliter och miljöföroreningar i vävnadssnitt med hjälp av masspektrometri, samtidigt som provens integritet bevaras för efterföljande analyser såsom spatial transkriptomik. Genom att flera avbildningsmodaliteter kan appliceras på ett och samma vävnadssnitt får forskare möjlighet att studera rumslig organisation över olika biologiska nivåer med oöverträffad detaljrikedom och precision.
Metoderna används för närvarande för att undersöka lipidmediatorer, inklusive prostaglandiner och leukotriener, och deras roll i inflammatoriska lungsjukdomar. Genom att kombinera histologisk analys och spatial transkriptomik från samma vävnadssnitt identifierar teamet specifika mikromiljöer i vävnaden som driver lipidmedierad inflammation vid astma. Wheelock-labbet använder även MSI för att visualisera miljökemikalier i vävnader. I ett nyligen genomfört arbete studerade gruppen upptag och fördelning av PFAS-föreningar i en zebrafiskmodell och kunde därmed avslöja metabol påverkan kopplad till kemikalieexponering med hög rumslig upplösning. Teamet kunde visa att individuella PFAS-ämnen (i detta fall PFOS och PFOA) uppvisar olika rumsliga distributionsmönster i zebrafisk, vilket tyder på att föreningarna kan ha organspecifika effekter [se figur nedan].
Wheelock leder också Small Molecule Mass Spectrometry Core Facility (KI-SMMS), som erbjuder expertstöd inom metabolism, försöksdesign och dataanalys. Oavsett om forskare behöver metabolomik, lipidomik, riktad fluxomik eller andra LC-MS-baserade analyser utvecklar KI-SMMS skräddarsydda lösningar som matchar specifika vetenskapliga behov. De senaste instrumentinvesteringarna stärker både core-facilitetens servicekapacitet och Wheelock-labbets forskningsmöjligheter – och bidrar till att driva IMM:s uppdrag att förstå hur miljökemikalier påverkar människors hälsa.