Johan Björkegren ny professor vid MedH

Stort grattis till din professur! Vad betyder den här titeln för dig? 

Den här tjänsten är ett viktigt erkännande för mig i Sverige och på KI. Ett erkännande som jag tror kommer vara avgörande för att jag på allvar ska kunna tävla om de större anslagen i Sverige och på EU-nivå. 

Vilken är din roll vid MedH?

Systemmedicin handlar i stora drag om att använda olika typer av ”omik” data för att kartlägga hur specifika molekylära funktioner är kopplade inte bara inom organ men också mellan dem. En konsekvens av detta är att vi ofta bidrar till samarbeten som sträcker sig över traditionella forskningsområden och inte sällan hjälper till med att sätta ett humant perspektiv på molekylära upptäckter som primärt gjorts i mus eller andra modellsystem. Framgent kommer jag även engagera mig i utbildningen i systemmedicin på KI och MedH.

Berätta om din forskargrupp

Egentligen är det 3 grupperingar. Jag har en del anslag kvar på Mount Sinai i New York och därmed folk som jobbar för mig där och med dem ett nätverk av USA-baserade samarbeten. 

Som 50% Estländare, är jag speciellt stolt över min grupp i Tartu som ansvarar för patientinsamling i studien STARNET (Stockholm-Tartu Atherosclerosis Reverse Network Engineering Task). 

På KI jobbar just nu Husain Talukdar som ”staff” bioinformatiker och post-doc, Katyayani Sukhavasi primärt med att generera och analysera ”single cell” data.  Ville Du Reitz som har gjort sin Master uppsats i gruppen avslutar läkarlinjen i höst för att påbörja sina doktorandstudier i januari. Till våren kommer Pontus Rydén från datavetenskapslinjen på KTH göra sin Masteruppsats i gruppen. 

Vad fokuserar gruppen på just nu?

Historiskt har mitt forskningsfokus varit på hjärtkärlsjukdom i relation till inflammatoriska och metabola sjukdomar. Det fokuset kvarstår men vi höjer nu blicken något för att om möjligt applicera nätverksmodeller på andra komplex sjukdomstillstånd som till exempel njursjukdomar. 

STARNET biobanken är världsunik i att den genom åren har genererat stora mängder omik data både på vävnads, och på senare år, cellnivå och inte bara från kärlbädden men parallellt också från de huvudsakliga metabola organen (lever, skelettmuskel och två typer av fettväv) i snart 2000 patienter. Med det antalet patienter, bredden av vävnader och samtida datadjup är en framtida förhoppning att vi ska kunna kartlägga det ”system” av biologiska nätverk som sammanbinder specifika molekylära funktioner och signalvägar i, och mellan vävnader.  Ett sådan system, tror vi, kommer vara av stor betydelse för att framgångsrikt utveckla precisionsmedicinen.

Vad vill du uppnå med din forskning? 

Jag vill uppnå säkrare och tidigare diagnos, framför allt av patienter som riskerar att drabbas av en plötslig hjärtattack eller stroke. Jag hoppas också på att vi ska kunna bidra till nätverksmodifierande läkemedel som gör att sjuka vävnader återgår till mer normal fysiologi.